هیئت رئیسه اتاق اصناف تهران انتقادات خود را به سامانه نوین اصناف مطرح کردند که صدور جواز بدون دریافت مستندات، اضافه نشدن گزینه ابطال یا تعلیق جواز کسب برای اتحادیه‌ها و رعایت نشدن قانون نظام صنفی در این روند از جمله این انتقادات است.